为保证反渗透设备的安全经济运行，不仅需要正确的运行操作，还需要有严格的运行管理制度，如制定必要的规章制度、质量保证体系，进行人员培训、运行分析、反事故演习等。通过管理工作，不断加强运行人员的工作责任心和提高运行人员的技术素质。
　　1.报表记录管理
　　对水处理设备的运行应建立运行报表记录制度。每班对运行工况进行监督，定时记录设备的运行状况如流量、压力、温度、水质、水箱液位，转机电流、电压，反洗、再生情况。设备异常、缺陷，交接班情况，计算班用水量、制水量等；建立设备缺陷台账，设备变更台账，工作票台账，运行分析台账，反事故演习台账等。
　　2.巡回检查
　　（1）每1-2h应对设条巡回检查一次。检查项目包括设备本体、管道、阀门、转动机械、油位、油质、振动、声音、气味、漏水与否，电源开关、就地表计、液位等情况。
　　（2）巡回检查应带好手电筒、听针、棉纱布以及必要的工具。
　　（3）在巡回检查中发现轻微缺陷，如盘根压兰漏水等应进行处理，缺油时应补油，油质劣化应进行换油，并对设备做好清洁工作。
　　（4）巡回检查中如发现异常，应及时进行分析，不能处理的缺陷应填写缺陷通知单，并做好交班记录。
　　3.定期维护工作
　　（1）定期切换。对系统有两台以上的泵，应定期（如每隔10-15d）切换运行。
　　（2）定期换油。一般转动设备每运行六个月更换一次油（或按设备使用说明要求换油）。
　　（3）对澄清池等设备应定期进行排污。
　　（4）对各种箱、槽定期进行冲洗。
　　（5）对各种表计、安全阀、减压阀定期进行校验。
　　（6）定期清洗试验用玻璃仪器，校验试验室仪表。
　　4.交接班工作
　　（1）交班前应做好仪器、仪表和现场的清洁工作。
　　（2）交班前设备运行工况，水箱、药箱液位等应符合交班规定。
　　（3）接班应分析主要设备的出水水质，了解所有运行和备用设条情况，检查水箱、药箱液位以及转动机械油位等。
　　（4）记录接班情况。